Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A5Q71RS6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC24A5Q71RS6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC24A5Q71RS6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC24A5Q71RS6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC24A5Q71RS6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC24A5Q71RS6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC24A5Q71RS6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC24A5Q71RS6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC24A5Q71RS6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms