Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP31Q70CQ4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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USP31Q70CQ4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
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USP31Q70CQ4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
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USP31Q70CQ4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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USP31Q70CQ4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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USP31Q70CQ4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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USP31Q70CQ4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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USP31Q70CQ4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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USP31Q70CQ4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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USP31Q70CQ4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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USP31Q70CQ4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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USP31Q70CQ4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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USP31Q70CQ4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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USP31Q70CQ4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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