Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
WDR88Q6ZMY6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WDR88Q6ZMY6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms