Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMIGD1Q6UXZ0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMIGD1Q6UXZ0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms