Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUSD4Q5VX71 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms