Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms