Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDSS1Q5T2R2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms