Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C3orf38Q5JPI3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms