Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms