Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms