Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms