Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q499Y3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q499Y3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms