Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKOR2Q2VWA4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms