Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FHOD3Q2V2M9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms