Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPROQ16827 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPROQ16827 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PTPROQ16827 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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