Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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