Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGCAQ16586 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SGCAQ16586 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SGCAQ16586 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SGCAQ16586 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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