Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms