Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NTRK3Q16288 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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