Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK4Q16099 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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