Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPTX1Q15818 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPTX1Q15818 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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