Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms