Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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BRD3Q15059 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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