Protein–RNA interactions for Protein: Q14749

GNMT, Glycine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNMTQ14749 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GNMTQ14749 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms