Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSPNQ14714 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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