Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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