Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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