Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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COL4A6Q14031 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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COL4A6Q14031 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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COL4A6Q14031 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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COL4A6Q14031 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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COL4A6Q14031 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL4A6Q14031 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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