Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTCH1Q13635 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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