Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL3Q13618 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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