Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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