Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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