Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1orf61Q13536 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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