Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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