Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRSQ13332 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRSQ13332 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms