Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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