Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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