Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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