Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TRAF1Q13077 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TRAF1Q13077 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TRAF1Q13077 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TRAF1Q13077 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TRAF1Q13077 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TRAF1Q13077 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TRAF1Q13077 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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TRAF1Q13077 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19■□□□□ 0.63
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TRAF1Q13077 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF1Q13077 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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