Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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