Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TROQ12816 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TROQ12816 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TROQ12816 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TROQ12816 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TROQ12816 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TROQ12816 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TROQ12816 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TROQ12816 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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