Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms