Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms