Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTDSPL2Q05D32 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms