Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC6Q03468 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms