Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CAV1Q03135 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAV1Q03135 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms