Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CAP1Q01518 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms