Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1BQ00975 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms