Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SH3BP2P78314 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SH3BP2P78314 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SH3BP2P78314 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2P78314 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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