Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms